隆庆（１５６７年—１５７２年）初，首辅高拱荐其为考功主事，出为广东佥事，招降大盗，倭寇骚扰广东，以水陆夹攻，擒获倭寇７０余人，受到嘉奖。万历年间（１５７３年—１６２０年），首辅张居正逐“拱党”，谪为两淮盐运司判官。历兵部郎中，出知建昌府（今江西水修西北），暇辄讲学。不久，经给事中邹元标推荐，擢为陕西提学副使，以身作则，考核肃然。万历二十年（１５９２年），升右佥都御史，出任福建巡抚，奏请以僧田十六入官。又募兵垦海坛地八万三千有奇，筑城建营舍，聚兵以守。三年后，擢南京大理卿，调兵部右侍郎，旋改北部左侍郎。道中被论，乞休。数年后卒于家，谥恭简，赠南京工部尚书。

许孚远一生精研理学，聚徒讲学，学宗良知，为王阳明正传。为学以克己为要，以反身寻究为攻。与当时名儒冯从吾、刘宗周、丁元荐友善。著有《论语述》、《敬和堂集》八卷、《大学述》、《中庸述》等。《四库总目》传于世。　

许孚远诗作

《平凉诸生从游崆峒山上，诗以勖之》

明 许孚远
登山自平地，高以下为基。脚跟如不力，崔嵬焉得跻。　

突兀五台峰，中有三天路。直上万仞岗，虚空更无柱。

所以大易训，礼卑而智崇。卑法业乃积，崇效德方隆。

文艺道德资，根深枝叶茂。培养欲沉潜，诵读宜宏富。

人伦庶物间，天则不可违。要令常著察，内省免瑕疵。

能以无碍心，而行真实地。高明亦中庸，攸往无不利。

穷达固有遇，尧桀在所趋。阿衡与陋巷，百代同光辉。

秦俗喜淳庞，况存圣哲矩。忠信肯好学，一日应千里。

吾愧尔师表，此志良勤劬。勉旃二三子，迈往毋踌蹰。