元朝推翻南宋以后，仍利用隋唐运河旧道转运漕粮，其路线大致为：由长江辗转入淮，逆黄河上达中滦旱站(今河南封丘西南)，陆运180里至淇门(今河南浚县西南)，再入御河(今卫河)，水运至大都。因运河河道多有壅塞，水陆转运颇多不便，而海上运路往往风信失时，又多倾覆。于是，元朝政府着手组织对大运河进行了大规模的治理与修凿。

　　至元十三年(1276年)开始修凿济州河。至元十七年(1280年)，疏通了通州运河。至元十八年至二十年，由奥鲁赤主持引汶水、泗水，从济州(今山东济宁)西北到须城安山(今山东东平西南)长150多里的济州河开通。