由于元朝统治者实行“四等人制”，“色目人”兼容了各种文化基因，被元政府任用为社会的管理阶层，如负责征收税赋、管理城市之类。朱元璋执政时，要求色目人必须与其他民族通婚。

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　　在法律文书上规定：“色目人氏，既居中国，许与中国人家结婚姻，不许与本类自相嫁娶。”而且，朱元璋还“引进”了伊斯兰教，循序渐进地来替代回族之前的信仰“明教”即波斯摩尼教，并修建了南京净觉寺，以供回族人士进行宗教活动。

　　在朱元璋的推动下，“色目人”进一步与汉民族融合，吸收了汉族的文化