董其昌第三子。官生。生母刘氏，配徐氏，子黄中、建中。董祖源秉承父志，擅长绘画，可惜流传甚少。其画风以南宗画为典范，直追元人，模仿董源之作尽显古人笔意，格在“逸品”。

董祖源在马寺购置住宅，勒令邻居拆迁，导致豪宅落成刚半年就被暴民付之一炬。

董祖源有二子黄中、建中。次子建中，生母是祖源妾许氏，也擅长书画，其花鸟得黄筌法。《董氏族谱》载康熙四十四年（1705）春康熙帝南巡，董建中进呈董其昌真迹一轴、花卉一册、万寿蟠桃一幅。康熙说起自幼跟随松江人沈荃学习董书，并了解了董建中家庭情况，给予赏赐照顾。董建中作品存世尚有，除博物馆藏品外，笔者亲鉴杭州灵隐寺藏董建中花鸟画一轴，是清初时风，以没骨画法为主。